Su aplicación debe realizarse con un buen cepillo de dientes, de modo que la pasta se introduzca en el espacio interdental. Si desea un efecto antiséptico, se debe dejar en contacto con la mucosa durante uno o dos minutos antes de enjuagar con agua. La limpieza de los dientes debe realizarse siempre que sea posible justo después de las comidas, y también al levantarse y al acostarse.
En casos más graves o cuando el estado de las encías no soporta el uso del cepillo, la Pasta Dentífrica Couto se puede aplicar con la yema del dedo índice, masajeando suavemente, y dejándola igualmente en contacto con la mucosa durante algún tiempo.